好酸性細菌Acidocella facilis 22Mの制限修飾系遺伝子のクローニングと塩基配列決定

好酸性細菌Acidocella facilis 22Mの制限修飾系遺伝子のクローニングと塩基配列決定

レコードナンバー670003論文タイプ学術雑誌論文
ALIS書誌IDZZ00015342NACSIS書誌IDAN00033029
著者名山岡 誠司
田村 隆
竹信 尚典
ほか3名
書誌名岡山大學農學部學術報告 = Scientific report of the Faculty of Agriculture, Okayama University
別誌名Scientific reports of the Faculty of Agriculture, Okayama University
岡山大学農学部学術報告
発行元岡山大學農學部
巻号,ページ92号, p.9-15(2003-02)ISSN04740254
全文表示PDFファイル (684KB) 
抄録CGATCGを認識するAfa22MI制限修飾系遺伝子を好酸性細菌Acidocella facilis 22Mより、クローニングし、塩基配列を決定した。その結果、C5-シトシンメチラーゼに特徴的なモチーフが保存されたM.Afa22MI遺伝子、その上流に、M.Afa22MI遺伝子とは逆方向に、very short patch repair endonuclease様タンパク質遺伝子(Afa22MI vsr)、M.Afa22MI遺伝子の下流にM.Afa22MI遺伝子と同方向に、制限酵素(R.Afa22MI)遺伝子と推定されるオープンリーディングフレームが見出された。M.Afa22MIの推定アミノ酸配列は、Xanthomonas oryzae pv. oryzae由来M.XorIIの配列と全体で約63%、variable region内で約53%の高い配列類似性を示した。また、Afa22MI vsrの推定アミノ酸配列も、M.XorIIに付随するXorII vsrの配列と約66%の高い類似性を示した。
索引語遺伝子;推定;配列;酸性;細菌;塩基配列;アミノ酸配列;タンパク質;制限酵素;Afa22MI
引用文献数11
登録日2011年03月05日
収録データベースJASI, AGROLib

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