メロンえそ斑点ウイルス-スイカ系統の全ゲノム配列とRT-PCRによる検出

メロンえそ斑点ウイルス-スイカ系統の全ゲノム配列とRT-PCRによる検出

タイトルメロンえそ斑点ウイルス-スイカ系統の全ゲノム配列とRT-PCRによる検出
要約鳥取県のえそ症状を示すスイカから分離された球状ウイルスは、既知のメロンえそ斑点ウイルス(MNSV)と同一のゲノム構造を持つが、外被タンパク質遺伝子等の配列に相違があり、宿主域も若干異なることから、MNSVの新系統(スイカ系統)である。
キーワードメロンえそ斑点ウイルス、スイカ系統、Carmovirus
担当機関(独)農業・食品産業技術総合研究機構 中央農業総合研究センター 昆虫等媒介病害研究チーム
連絡先029-838-8093
区分(部会名)関東東海北陸農業
区分(部会名)共通基盤
分類研究、参考
背景・ねらい鳥取県の葉や果実にえそ症状を示すスイカから、メロンえそ斑点ウイルス(MNSV)と思われる球状ウイルスが分離された。しかし、このウイルスは、従来のMNSV抗体との反応が弱く、宿主域も若干異なっていたことから、そのゲノム構造を明らかにして本ウイルスの分類学的位置を決定する。また、得られたゲノム情報を利用して、本ウイルスを特異的に検出するRT-PCR用プライマーを作製する。
成果の内容・特徴
  1. 鳥取県のスイカから分離された本ウイルスは直径約30nmの球状ウイルスである。宿主範囲はウリ科植物に限られるが、既知のMNSVと異なり、メロン(品種:雅春秋系)では感染が認められない(図1)。
  2. 本ウイルスは、MNSVと同様に、土壌中に生息するオルピディウム菌によって、媒介される(データ省略)。
  3. 本ウイルスの全塩基数は4261で、5つのタンパク質遺伝子をコードしており、既知のMNSVとゲノム構造は同一である(Accession: AB232925)(図2)。
  4. 既知のMNSVとアミノ酸配列を比較すると、複製酵素(p89)は約82%、外被タンパク質(p42)は約75%の相同性である(表1)。しかし、MNSVが属するCarmovirus属ウイルスの分類基準(Virus Taxonomy, 8th report of ICTV, 2005)では、複製酵素と外被タンパク質の相同性がそれぞれ52%以下、41%以下が別種の基準であることから、本ウイルスは、MNSVの新系統(スイカ系統)である。
  5. 既知のMNSV外被タンパク質遺伝子と相同性の低い領域に設計したプライマー(MNSV-W-F:TCCGACTACCAACACGACTG、MNSV-W-R:TACCACCAGAGGTGA CAACG、増幅サイズ420bp)でRT-PCRを行うと、MNSVスイカ系統を特異的に検出できる(図3)。
成果の活用面・留意点
  1. MNSVスイカ系統は、従来のMNSV抗体では検出が困難なため、本RT-PCRはMNSVスイカ系統の特異的検出・同定に有用である。
  2. 従来のMNSVは、ユウガオに対する病原性が弱いため、ユウガオ台木スイカでは発生しにくい。
具体的データ
図1 MNSVスイカ系統のウイルス粒子(左)とメロンおよびスイカ子葉における病徴(右)
図2 MNSV スイカ系統のゲノム構造
表1 既知のMNSVとのアミノ酸配列の比較
図3 RT-PCRによるMNSVスイカ系統の検出
予算区分基盤、菌媒介ウイルス
研究期間2005~2008
研究担当者神田絢美、大木健広、津田新哉
発表論文Ohki et al. (2008) Phytopathology 98, 1165-1170
Ohki et al. (2008) Phytopathology 98, 1165-1170
発行年度2008
収録データベース研究成果情報

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