ばれいしょの病害虫抵抗性遺伝子を選抜するDNAマーカー

ばれいしょの病害虫抵抗性遺伝子を選抜するDNAマーカー

タイトルばれいしょの病害虫抵抗性遺伝子を選抜するDNAマーカー
要約DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる。
キーワードジャガイモシストセンチュウ、ジャガイモYウイルス、抵抗性遺伝子、DNAマーカー
担当機関道立中央農試 基盤研究部 遺伝子工学科
連絡先0123-89-2584
区分(部会名)北海道農業
分類研究、普及
背景・ねらい
    ばれいしょの病害虫抵抗性品種を早期に育成するために、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを検出するDNAマーカーを開発する。現在、実用的なDNAマーカーはないことから、高精度で使いやすいマーカーの開発をめざす。
成果の内容・特徴
  1. DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる(表1)。PCR反応は、HotStar Taq DNA Polymerase(QIAGEN)を利用する。アニーリング温度は55℃とする。
  2. H1遺伝子、Rychc遺伝子ともに、遺伝子の両側を挟む2マーカーを同時に増幅することにより、精度よく検定できる。また、ばれいしょの顆粒性澱粉合成酵素遺伝子GBSSを検出するプライマーペアを追加し、必ず981bpの増幅断片が得られるように設計することでPCR作業エラーによる誤判定を回避できる(図1)。
  3. 一個体から抽出したDNAでシストセンチュウおよびYウイルス抵抗性遺伝子のマーカー検定に利用できるため、効率的である。
  4. 検定期間は、従来法ではシストセンチュウおよびYウイルスともに2~3か月間を要したが、DNAマーカー検定では1日に200点程度を処理できる。
  5. 検定試料は、従来法では休眠を打破した塊茎が必要であるが、DNAマーカー検定では葉に加え、塊茎からのDNA抽出法(表2)も確立したため、検定は通年で実施可能である。
成果の活用面・留意点
  1. 本研究で開発したDNAマーカー検定法は、ばれいしょの品種改良における選抜に活用できる。
平成20年度北海道農業試験会議(成績会議)における課題名および区分
「ばれいしょの病害虫抵抗選抜に有効なDNAマーカー」(研究参考)
具体的データ
表1
表2
図1
予算区分民間受託
研究期間2004~2008
研究担当者竹内徹、佐々木純、鈴木孝子、堀田治邦、樋浦里志、池谷聡、藤田涼平、千田圭一
発行年度2008
収録データベース研究成果情報

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