土壌生態系における放線菌の特性の解明（６９）
土壌生態系における放線菌の特性の解明（６９）
| 課題番号 | 1992000562 | ||
|---|---|---|---|
| 研究機関名 | 農業環境技術研究所（農環研） | ||
| 研究期間 | 継Ｓ５８〜Ｈ０４ | ||
| 年度 | 1992 | ||
| 研究問題 | 農業環境資源の賦存量の把握及び特性の解明と機能の評価 | ||
| 大課題 | 環境生物資源の特性の解明と機能の評価 | ||
| 中課題 | 環境生物の特性の解明と機能の評価 | ||
| 小課題 | 土壌生態系における放線菌の特性の解明（６９） | ||
| 摘要 | 土壌生態系で重要な役割を担い，生物防除での有効利用も期待されている，放線菌のキチナーゼに着目し，その解析を行う。Ｓ． ｌｉｖｉｄａｎｓのキチナーゼ遺伝子，ｃｈｉＡの塩基配列を決定した。ＯＲＦは１７１３塩基対，コード領域のＧ＋Ｃ含量は７０ｍｏｌ％であった。他のキチナーゼ遺伝子の中でｃｈｉＡに最も高い相同性を示したのは，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｉｒｃｕｌａｎｓのｃｈｉＤであった。塩基配列より推定したアミノ酸配列に対するホモロジー検索の結果，Ｓ．ｌｉｖｉｄａｎｓの全てのキチナーゼは，シグナル配列，基質吸着ドメイン，フィブロネクチンタイプ■リピートユニット相同ドメイン，活性ドメインの，４つのホモロジードメインに分かれていることが判明した。また，細菌のキチナーゼは少なくとも３つのグループに分かれること，植物のキチナーゼのクラス■と■は，細菌のそれとはかなり異なることが明らかになった。 | ||
| 研究分担 | 環境生物・土微利用研 | ||
| パーマリンク | https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/3030032023 | ||
| 収録データベース | 研究課題データベース | ||