(3)カイコ等昆虫のゲノムリソースの開発と利用

(3)カイコ等昆虫のゲノムリソースの開発と利用

課題番号2009013981
研究機関名農業生物資源研究所
研究期間2006-2010
年度2009
大課題該当なし
中課題(3)カイコ等昆虫のゲノムリソースの開発と利用
小課題(3)カイコ等昆虫のゲノムリソースの開発と利用
大項目第2 国民に対して提供するサービスその他の業務の質の向上に関する目標を達成するためとるべき措置
中項目1.試験及び研究並びに調査
摘要1.カイコ完全長cDNAライブラリーについては、新たに3種のライブラリー(蛹期の翅、蛹期の精巣、蛹期の卵巣)を作成・解析した。これまでと合わせて20の異なる組織のライブラリーを解析し、中期計画の目標としていた12,000個以上の完全長cDNAクローンの配列決定を1年前倒しで達成した。2.塩基配列情報と遺伝地図・形質地図等とを統合した統合データベースKAIKObaseを整備し公開した。また、次年度に予定しているカイコゲノムアノテーションの環境を整えるため、コア・データベースを汎用性の高いChadoに移行して保守管理を容易にするとともに外部の他のデータベースとの連接性を高めた。さらに、ウンカ、ユスリカなどのcDNAデータベースにデータを追加するとともにヨコバイ、カメムシなどのデータベースを新たに構築した。3.カイコ遺伝子全28連鎖群中の164ヶ所のギャップのうち127ヶ所において、ギャップを埋めるブリッジBACを見いだしFISH法による確認を行った。4.カイコ変異系統の作出について、これまでのBmA3-GAL4 ミューテーターに加えて新たにAyFib-GAL4 ミューテーターを用いたエンハンサートラップ系統を作出し、発現解析や挿入位置解析を行った。また、エンハンサートラップ系統に加えてジーントラップ系統の作出と解析を始め、これまでに合計2,000 系統を作出する交配を完了し、中期計画目標を達成する目処をつけた。また、ここで確立した形質転換技術を、5.の遺伝子機能解析において候補遺伝子の機能の同定に利用した。5.遺伝子機能解析については、1型カイコ濃核病ウイルス抵抗性遺伝子nsd-1、Bt菌Cry1Ab毒素抵抗性遺伝子を単離し機能解析を進めている。また、着色非休眠卵(pnd、pnd-2)及び第2白卵(w-2)についても候補遺伝子をほぼ特定した。オープンラボ及びKAIKObaseを通じた情報提供により、外層黄繭(C )、伴性赤蟻(sch)、褐円(L)、黄体色(lem)、ワクジー油(ow)、赤血(rb)、褐頭尾斑(bts)、エスプリ(spli)変異体の原因遺伝子同定に協力した。
研究分担(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所,昆虫科学研究領域,昆虫ゲノム研究・情報解析ユニット
(独)農業生物資源研究所
協力分担関係国立大学法人東京大学
社団法人農林水産先端技術産業振興センター
予算区分技会交付金研究 委託・バイテク先端技術[アグリゲノム] 技会・その他 文科省[科研費] 文科省・その他
業績(1)Deveropment of transgenic silkworm Bombyx mori for functional genomics
(2)Carotenoid cocoon coloration is controlled by a combination of a CD36/SR-BI-related transmembrane receptor and a cytosolic START lipid-binding protein in the silkworm Bombyx mori
(3)A CD36-related transmembrane protein facilitates selective uptake of carotenoid pigment and cocoon coloration in coordination with an intracellular START lipid binding protein
(4)SilkDB v2.0: a platform for silkworm (Bombyx mori) genome biology
(5)The genome of a lepidopteran model insect, the silkworm Bombyx mori
(6)The genome of a lepidopteran model insect, the silkworm Bombyx mori
(7)Construction of an enhancer trap system Bombyx Trap database in silkworm Bombyx mori
(8)Repression of tyrosine hydroxylase is responsible for the sex-linked chocolate mutation of the silkworm, Bombyx mori
(9)カイコゲノムデータベースの活用-ポジショナルクローニングの場合 2009年
(10)Identification and molecular characterization of a sex chromosome rearrangement causing a soft and pliable (spli) larval body phenotype in the silkworm,
(11)Molecular genetics of densovirus resistance in the silkworm, Bombyx mori
(12)カイコ卵休眠遺伝子pnd,pnd2の解析
(13)Geographical analysis on South-west islands for evolution of Bombyx mandarina (Japan) using rDNA sequence
(14)カイコゲノム研究の現状と害虫防除研究への展望 公開シンポジウム「ポストゲノム時代の害虫防除研究のあり方」
(15)Lepido-DB, a new bioinformatic resource for the annotation and cross-comparisons of lepidopteran genomes
(16)カイコ由来培養細胞BmN細胞を用いたカイコ濃核病ウイルス1型抵抗性遺伝子nsd-1の機能解析
(17)カイコ濃核病ウイルス抵抗性の分子遺伝学
(18)カイコ1型濃核病ウイルス抵抗性遺伝子nsd-1とnid-1によるウイルス抵抗性機構の違い
(19)BmDNV-2感受性遺伝子(+nsd-2)の強制発現による感受性誘導の試み
(20)Evolutionary analysis of rDNA sequence differences among Bombyx mandarina inhabiting
(21)Yellow-e determines the color pattern of larval head and tail spots of the silkworm Bombyx mori
(22)Proteome analysis of silkworm 1. Fat body
(23)Proteome analysis of silkworm 2. Hemolymph
(24)Proteome analysis of silkworm 3. Malpighian tube
(25)Non-susceptibility genes to Bombyx densovirus type 1, Nid-1 and nsd-1, affect distinct steps of the viral infection pathway
(26)Expression of the Japanese oak silkworm Antheraea yamamai fibroin gene in the domesticated silkworm Bombyx mori
(27)A CD36-related transmembrane protein is coordinated with an intracellular lipid-binding protein in selective carotenoid transport for cocoon coloration
(28)Reprobing multicolor FISH preparations in lepidopteran chromosome
(29)カイコプロテオームの時系列的分析とデータベースの構築
(30)原子間力顕微鏡と包埋切片法併用による生物試料・食品素材の解析
(31)KAIKObase: An integrated silkworm genome database and data mining tool
(32)包埋切片の原子間力顕微鏡観察によるカイコ精子鞭毛のナノスケール構造解析
(33)Identification of 2nd chromosome region translocated onto the W chromosome by RFLP with EST-cDNA clones in the Gensei-kouken strains of the mulberry silkworm, Bombyx mori L
(34)走査型プローブ顕微鏡によるカイコ精子及び澱粉粒子包埋切片の高精度観察
(35)Cell-free cloning using multiply-primed rolling circle amplification with modified RNA primers
(36)カイコゲノム研究の現状と今後の展開
(37)カイコゲノム研究の現状と害虫防除研究への展望
(38)Construction of a binary transgenic gene expression system for recombinant protein production in the middle silk gland of the silkworm Bombyx mori
(39)Establishment of the segregation models for Bt toxins and the linkage analysis of resistant genes in the silkworm, Bombyx mori
(40)カイコのジーントラップ系統のベクター挿入部位の解析
(41)カイコ褐頭尾斑および第二褐頭尾斑遺伝子の遺伝子構造の比較
(42)The silkworm mutant lemon (lemon lethal) is a potential insect model for human Sepiapterin reductase deficiency
(43)Extensive conserved synteny of genes between the karyotypes of Manduca sexta and Bombyx mori revealed by BAC-FISH mapping
(44)Sequeucing the genome of the major pest, the cotton bollworm, Helicoverpa armigera: a model for the evolution of complex ecological traits.
(45)走査型プローブ顕微鏡応用によるゲノム解析技術の開発
(46)Synteny conservation and genome rearrangements between the silkworm Bombyx mori and the noctuid pests Helicoverpa armigera and Spodoptera frugiperda
(47)The mutant phenotypes of lemon and lemon lethal are controlled by the sepiapterin reductase gene of the silkworm, Bombyx mori
(48)ジーントラップ法によるカイコ変異体の表現型の調査
(49)Conservation of silk genes in Trichoptera and Lepidoptera
(50)カイコ・エンハンサートラップ系統とデータベース(Bombyx Trap DataBase)の開発
(51)Silkworm genome analysis 8: Outline of KAIKObase, integrated silkworm genome database, and its usage
(52)wnt1 plays a crucial role in the spot marking formation on larval segment of Lepidoptera
(53)バキュロウイルス遺伝子発現ベクター系を利用したDNV-2抵抗性遺伝子産物の生産
(54)Atomic force microscopy imaging of biological samples using resin-embedded section method
(55)Transgenic silkworm as a tool for the analysis of gene function
(56)Nanometer-scale structure analyses of food-material by atomic force microscopy combined with resin embedded section.
(57)How did Bombyx adapt to mulberry? - A hypothesis in comparative genomics
(58)Deveropment of transgenic silkeorm Bombyx Mori for new uses and functional genomics
(59)Construction of enhancer trap system and Bombyx Trap DataBase for the analysis of gene function in silkworm Bombyx mori
(60)Construction of an enhancer trap system and Bombyx Trap DataBase for the analysis of gene function in silkworm Bombyx mori
パーマリンクhttps://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/3030093701
収録データベース研究課題データベース

研究課題アクセスランキング

Copyright 2017 農林水産省 農林水産技術会議事務局筑波産学連携支援センター

Tsukuba Business-Academia Cooperation Support Center, Agriculture, Forestry and Fisheries Research Council Secretariat