完全長cDNAの解読によるカイコゲノム構造の解明

完全長cDNAの解読によるカイコゲノム構造の解明

課題番号2009013136
研究機関名独立行政法人農業生物資源研究所,東京大学,農林水産先端技術産業振興センター
研究期間2007-2011
年度2009
小課題完全長cDNAの解読によるカイコゲノム構造の解明
摘要新たに4つの完全長cDNAライブラリーを作製・解析し、合計20個のライブラリーから完全長cDNAクローンを選び出し、primer walking法とSolexa法によって現在11,500個以上の完全配列を決めた。カイコ完全長cDNAデータベースに編集し、課題担当者が利用できる体制を整備した。KAIKObaseに完全長データベースを統合する作業を進めた。
予算区分委託・バイテク先端技術[アグリゲノム]
業績(1)SilkDB v2.0: a platform for silkworm (Bombyx mori ) genome biology.
(2) Genome-wide analysis of host gene expression in the silkworm cells infected with Bombyx mori
(3)Yellow-E determines the color pattern of larval head and tail spots of the silkworm, Bombyx mori.
(4)カイコゲノムの全貌
(5)KAIKObase: An integrated silkworm genome database and data mining tools.
(6)A 25 bp-long insertional mutation in the BmVarp gene causes the waxy translucent skin of the silkworm, Bombyx mori.
(7)A comparative analysis of serpin genes in the silkworm genome.
(8)Abnormal red body coloration of the silkworm, Bombyx mori, is caused by a mutation in a novel kynureninase.
(9)The silkworm mutant lemon (lemon lethal) is a potential insect model for human Sepiapterin reductase deficiency.
(10)Analysis of ecdysone-pulse responsive region of BMWCP2 in wing disc of Bombyx mori.
(11)A Basic-HLH Transcription Factor, HLH54F, Is Highly Expressed in the Prothoracic Gland in the Silkworm Bombyx mori and the Fruit Fly Drosophila melanogaster.
(12)Silkworm Z chromosome is enriched in testis-specific genes.
(13)Conservation of Silk Genes in Trichoptera and Lepidoptera.
パーマリンクhttps://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/3030165093
収録データベース研究課題データベース

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