イネ科作物遺伝子解析のための基盤整備

イネ科作物遺伝子解析のための基盤整備

課題番号2009014759
研究機関名独立行政法人農業生物資源研究所,独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構 北海道農業研究センター,農林水産先端技術産業振興センター
研究期間2008-2012
年度2009
小課題イネ科作物遺伝子解析のための基盤整備
摘要遺伝子単離過程で絞られた候補領域について種々の情報を得るため、研究基盤ツールの作成を行った。具体的には、1)配列情報抽出、2)ブラスト検索、3)特定の遺伝子座におけるSNPマーカー作成ツールの3種について開発を行い、実際に作製したDNAマーカーを用いて形質遺伝子の領域を限定することができた。合計8つのBACライブラリーを構築し、選抜マーカーを利用して遺伝子領域を含むBACを41個選抜し、19個の配列を決定して遺伝子単離の加速化に貢献した。
予算区分委託・バイテク先端技術[新農業展開ゲノムプロ]
業績(1)Development of genome-wide simple sequence repeat markers using whole-genome shotgun sequences of sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench)
パーマリンクhttps://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/3030166443
収録データベース研究課題データベース

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