系譜ハプロタイプの推定と育種基盤の確立

系譜ハプロタイプの推定と育種基盤の確立

課題番号2011017848
研究期間2010-2014
年度2011
中課題系譜ハプロタイプの推定と育種基盤の確立
摘要飼料イネ品種育成の系譜で重要と思われる品種群について、複数の品種組み合わせに由来するSNPソースを用いた遺伝子型調査を行い、飼料イネ識別用SNPセットを作成した。バイオマスに関連して抽出された20ヶ所のゲノム領域のうち3ヶ所の検証を進めた。バイオマスに関連する重要遺伝子について、飼料イネ品種群における配列比較を行った。ゲノムシャッフリング基礎集団について4系交配まで進めた。ゲノムシャッフリングによる連鎖不均衡ブロック変化のシミュレーションを行った。
予算区分イノベーション創出事業
業績(1)「コシヒカリ」の全ゲノム塩基配列解読−日本のおコメの起源と変遷が明らかに−
パーマリンクhttps://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/3030174820
収録データベース研究課題データベース

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